公路：沪杭甬高速公路、320国道（上海—昆明）穿境而过，善江一级公路（平湖—嘉善—江苏黎里）连接318国道（上海—西藏）；在建的杭州湾大通道（上海—宁波）、申嘉湖高速公路（上海—嘉兴—湖州）及规划中的苏通高速公路（嘉兴—苏州—南通）经过县境。

空运：西有杭州萧山国际机场（120公里），东有上海虹桥国际机场（72公里）、上海浦东国际机场（105公里）。

铁路：沪杭铁路复线穿境而过，设有货运、客运站（属上海铁路局），可直达全国28个省市。

海运：南有万吨级的东方大港乍浦港（35公里），北有国际集装箱运输大港上海港（120公里），东南处有国家重点开发建设的四大国际深水中转港之一的宁波港（直线距离120公里），杭州湾跨海大通道贯通后也将成为嘉善的主要出入港之一。

河运：杭申甲级航线穿越县境，属国家4级内河航道，单船通行能力为300-500吨级，并连接京杭大运河。